Игрок выступит в роли командира одного из таких отрядов, напоминающих Thunder Tier One — им предстоит заниматься разведкой этих мест по всему миру и отправлять заказчикам найденные технологии и данные той самой цивилизации. Но в процессе выполнения миссий герои начнут узнавать правду о правительственных заговорах и целях использования этих технологий. Постепенно становится понятно, что тот самый «первый контакт» оказался лишь верхушкой айсберга проблем, которые грозят Земле — на самом деле в опасности оказалось всё человечество.